Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm28945-201ENSMUST00000187780 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm29622-201ENSMUST00000190914 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd2b-204ENSMUST00000137337 2641 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm37040-201ENSMUST00000191740 1824 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Rassf5-202ENSMUST00000068564 3076 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gulo-201ENSMUST00000059970 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Fndc9-201ENSMUST00000060185 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Zfp568-204ENSMUST00000177931 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Mill2-206ENSMUST00000228493 2043 ntAPPRIS P4 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm38148-201ENSMUST00000195166 3012 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Adam6a-201ENSMUST00000053086 2558 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm45705-201ENSMUST00000211831 2134 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Adgrf4-201ENSMUST00000024711 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Arid1a-201ENSMUST00000008024 6486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Zfp942-202ENSMUST00000091879 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Nedd4l-211ENSMUST00000226058 3393 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 AC117245.3-201ENSMUST00000217495 2176 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Mmel1-201ENSMUST00000079269 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Far1-211ENSMUST00000164745 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Cipc-205ENSMUST00000187814 4098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Cipc-201ENSMUST00000038369 4098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm20705-201ENSMUST00000177278 1921 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm43318-201ENSMUST00000199939 1949 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Bag6-211ENSMUST00000173550 3536 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm42777-201ENSMUST00000196026 3603 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Ctage5-220ENSMUST00000177225 2872 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 1700063K16Rik-202ENSMUST00000191341 952 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Egf-201ENSMUST00000029653 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gabpa-202ENSMUST00000114184 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm37464-201ENSMUST00000192431 2220 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Mdga2-212ENSMUST00000222987 1388 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 March1-206ENSMUST00000110256 3288 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Csnk2a1-201ENSMUST00000099224 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Lrba-201ENSMUST00000107635 9888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm43481-201ENSMUST00000201715 3672 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 9930022D16Rik-201ENSMUST00000055404 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm35048-201ENSMUST00000192105 2802 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Slco1b2-204ENSMUST00000203597 1965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Olfr272-203ENSMUST00000213989 1973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Ndst2-201ENSMUST00000047490 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gtpbp8-204ENSMUST00000162512 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Ces2b-201ENSMUST00000059449 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Ppip5k1-203ENSMUST00000110626 5171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Ralgps1-204ENSMUST00000113165 6192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gprin2-203ENSMUST00000226613 10354 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Rfx2-201ENSMUST00000002444 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Unc13d-203ENSMUST00000106451 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Unc13d-201ENSMUST00000075036 3967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 C330021F23Rik-202ENSMUST00000136592 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.1 ms