Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Usp30Q3UN04 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Usp30Q3UN04 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Usp30Q3UN04 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Usp30Q3UN04 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Usp30Q3UN04 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Usp30Q3UN04 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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Usp30Q3UN04 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp30Q3UN04 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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