Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Grin2cQ01098 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms