Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm9583-201ENSMUST00000219613 1843 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm12004-201ENSMUST00000117869 718 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Nectin3-205ENSMUST00000121245 953 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm22987-201ENSMUST00000122757 246 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm16058-201ENSMUST00000124392 427 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm10045-201ENSMUST00000178657 483 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Smarce1-ps1-201ENSMUST00000180067 1077 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm40578-202ENSMUST00000221429 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Grxcr2-201ENSMUST00000097591 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Asb5-201ENSMUST00000033918 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Olfr1511-202ENSMUST00000214168 1468 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 AC167565.2-201ENSMUST00000227042 1870 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm22777-201ENSMUST00000104091 129 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm13217-201ENSMUST00000120466 953 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm12551-201ENSMUST00000122073 726 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm23820-201ENSMUST00000158450 300 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Tmem89-202ENSMUST00000192852 945 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm37261-201ENSMUST00000194360 1101 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 AC134607.1-201ENSMUST00000214707 485 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm21818-202ENSMUST00000225144 894 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Tssk4-204ENSMUST00000226591 1243 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 2900011O08Rik-201ENSMUST00000056521 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Cyp19a1-201ENSMUST00000034811 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 AC187103.1-202ENSMUST00000223904 1536 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Cass4-204ENSMUST00000228775 2629 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Dcdc5-203ENSMUST00000126340 396 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm16548-201ENSMUST00000133341 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm7337-201ENSMUST00000180954 1125 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm26930-201ENSMUST00000194874 1244 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Hbq1a-201ENSMUST00000020535 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm18129-201ENSMUST00000208834 1044 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Calb2-202ENSMUST00000212297 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Npy-201ENSMUST00000031843 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Spata17-201ENSMUST00000027908 1303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Tmx2-202ENSMUST00000111664 1926 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm32072-201ENSMUST00000200803 1434 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Grin2bQ01097 Gm28578-203ENSMUST00000189196 1470 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms