Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atp5bP56480 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atp5bP56480 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atp5bP56480 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atp5bP56480 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atp5bP56480 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atp5bP56480 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Atp5bP56480 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atp5bP56480 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atp5bP56480 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atp5bP56480 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms