Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmod1P49813 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms