Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Rab38-202ENSMUST00000208478 579 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm40723-201ENSMUST00000219407 603 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm18623-201ENSMUST00000219860 953 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Smim4-201ENSMUST00000049732 311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm5054-201ENSMUST00000119351 453 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm15798-201ENSMUST00000120082 408 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Zfp740-205ENSMUST00000121206 795 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gzmg-201ENSMUST00000015578 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm17197-201ENSMUST00000163160 452 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm20455-201ENSMUST00000174100 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm29485-201ENSMUST00000190220 282 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm38132-201ENSMUST00000193358 707 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm34780-201ENSMUST00000193896 949 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm8704-201ENSMUST00000197181 435 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm43551-201ENSMUST00000197221 440 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Wars2-205ENSMUST00000198044 403 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm3922-201ENSMUST00000200519 435 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 1500002F19Rik-203ENSMUST00000211184 375 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm34237-201ENSMUST00000220575 1257 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Yipf7-201ENSMUST00000031045 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Olfr1512-201ENSMUST00000071221 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 C330021F23Rik-202ENSMUST00000136592 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Pdha2-201ENSMUST00000057860 2352 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Hsd17b13-203ENSMUST00000120320 1118 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 4933406K04Rik-201ENSMUST00000124068 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm16008-203ENSMUST00000181389 480 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 4930500F04Rik-203ENSMUST00000202177 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Cox7a1-202ENSMUST00000208441 485 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm5951-201ENSMUST00000220283 504 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 AC124400.2-201ENSMUST00000224939 253 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 AC160109.1-201ENSMUST00000225592 729 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Opn1mw-201ENSMUST00000033771 1227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Ccr8-201ENSMUST00000048777 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Mapk1ip1-202ENSMUST00000118810 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm31182-201ENSMUST00000219061 2391 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprkP35822 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm16131-201ENSMUST00000131007 659 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm12977-201ENSMUST00000133742 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm11493-201ENSMUST00000134567 566 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Plut-201ENSMUST00000172461 855 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Gm6633-201ENSMUST00000173851 270 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprkP35822 1700034B16Rik-201ENSMUST00000180957 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Ccdc153-206ENSMUST00000216632 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprkP35822 AC156016.4-201ENSMUST00000227470 647 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Dbil5-201ENSMUST00000040806 581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Fam13c-203ENSMUST00000173042 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Harbi1-201ENSMUST00000090608 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprkP35822 Cfap100-201ENSMUST00000062750 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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