Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
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Ggta1P23336 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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Ggta1P23336 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Ggta1P23336 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Ggta1P23336 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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