Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
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P18530 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
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P18530 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
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P18530 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
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P18530 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
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P18530 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
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P18530 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
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P18530 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
P18530 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
P18530 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
P18530 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
P18530 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
P18530 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
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P18530 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
P18530 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
P18530 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
P18530 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
P18530 Trpm5-201ENSMUST00000009390 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
P18530 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
P18530 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
P18530 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
P18530 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
P18530 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
P18530 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
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P18530 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
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P18530 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
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P18530 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
P18530 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
P18530 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
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P18530 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
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P18530 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
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P18530 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
P18530 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
P18530 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
P18530 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
P18530 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
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P18530 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
P18530 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
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P18530 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
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P18530 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
P18530 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
P18530 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
P18530 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
P18530 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
P18530 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
P18530 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
P18530 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
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P18530 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
P18530 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
P18530 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
P18530 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
P18530 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
P18530 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
P18530 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
P18530 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
P18530 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
P18530 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
P18530 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
P18530 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
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