Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Rsrc1-201ENSMUST00000046542 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Gm45139-201ENSMUST00000206543 2057 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Blnk-201ENSMUST00000054769 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Mdga2-212ENSMUST00000222987 1388 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Aplf-202ENSMUST00000065997 3132 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Opalin-201ENSMUST00000087176 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Rorc-201ENSMUST00000029795 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Arid5a-202ENSMUST00000115029 4329 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Sema4d-203ENSMUST00000110040 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Smg7-202ENSMUST00000073441 5767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Slc17a2-202ENSMUST00000099697 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Kcnmb1-201ENSMUST00000020362 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Pik3c3-203ENSMUST00000115812 3257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Slc28a2-202ENSMUST00000110524 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Tbx22-202ENSMUST00000118986 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Rps6kc1-201ENSMUST00000061611 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Mbnl1-203ENSMUST00000191747 4046 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 D030018L15Rik-203ENSMUST00000140253 2902 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Mgat4a-202ENSMUST00000143636 1802 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Inpp4a-207ENSMUST00000136846 3576 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Col10a1-201ENSMUST00000105511 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Nedd4l-211ENSMUST00000226058 3393 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Oc90-201ENSMUST00000060522 1909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Wdr93-201ENSMUST00000035622 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 AC133934.1-201ENSMUST00000223052 1761 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Derl3Q9D8K3 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms