Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Cldn22Q9D7U6 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Cldn22Q9D7U6 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Cldn22Q9D7U6 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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