Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Fam171a1-202ENSMUST00000072955 3364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Osbpl1a-204ENSMUST00000119043 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Csf2rb2-201ENSMUST00000096356 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Frmd6-201ENSMUST00000057859 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Clasp2-203ENSMUST00000166734 4108 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Lrba-204ENSMUST00000194759 9379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 D3Ertd751e-201ENSMUST00000026867 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Xlr3a-201ENSMUST00000074619 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Arid1a-201ENSMUST00000008024 6486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Atg16l1Q8C0J2 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Crispld2-203ENSMUST00000132583 4182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Tacc2-203ENSMUST00000084513 9029 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Syt2-201ENSMUST00000121990 6879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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