Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms