Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Cdkl2-202ENSMUST00000086978 4066 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BcanQ61361 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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BcanQ61361 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BcanQ61361 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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BcanQ61361 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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BcanQ61361 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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BcanQ61361 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BcanQ61361 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BcanQ61361 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms