Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm42836-201ENSMUST00000197198 728 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm8261-201ENSMUST00000119275 1208 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm44090-201ENSMUST00000204669 1834 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms