Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkn1P70268 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms