Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms