Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm38250-202ENSMUST00000195108 462 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm15937-201ENSMUST00000120727 1235 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd8P23463 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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