Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn22Q9D7U6 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms