Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Ccdc71-202ENSMUST00000193170 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Nop56Q9D6Z1 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Nop56Q9D6Z1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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Nop56Q9D6Z1 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Nop56Q9D6Z1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Nop56Q9D6Z1 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Ptk2b-202ENSMUST00000089250 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Nop56Q9D6Z1 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Nop56Q9D6Z1 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Nop56Q9D6Z1 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Nop56Q9D6Z1 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Nop56Q9D6Z1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm37048-201ENSMUST00000194827 5578 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nop56Q9D6Z1 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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