Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc63Q8CDV6 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms