Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Itga10-201ENSMUST00000029744 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 0610030E20Rik-201ENSMUST00000077783 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Prrc1-201ENSMUST00000025490 4801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Osgep-202ENSMUST00000159292 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Eci2-201ENSMUST00000021854 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gpatch4-201ENSMUST00000029707 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Tbck-202ENSMUST00000169172 6578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Elavl1-204ENSMUST00000209010 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Parp3-201ENSMUST00000067218 2962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Zfp568-204ENSMUST00000177931 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 1700010I14Rik-203ENSMUST00000151609 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Ncapg2-201ENSMUST00000084828 4684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Pde4d-209ENSMUST00000122041 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Nfia-203ENSMUST00000092532 9382 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Nat8f5-201ENSMUST00000032074 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Fbxl12-206ENSMUST00000148631 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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