Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm5092-201ENSMUST00000188185 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Harbi1-201ENSMUST00000090608 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm11629-201ENSMUST00000123784 384 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm11947-201ENSMUST00000125275 273 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm3617-201ENSMUST00000173076 555 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Siglech-208ENSMUST00000173835 833 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm3534-201ENSMUST00000182522 1001 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm37144-201ENSMUST00000195445 1150 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm5684-201ENSMUST00000198419 961 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm43103-201ENSMUST00000199021 802 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm5905-201ENSMUST00000211731 580 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 AC124484.1-201ENSMUST00000223212 652 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Ube2q1-202ENSMUST00000196726 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Wdr95-207ENSMUST00000202902 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Il24-201ENSMUST00000121040 1159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm17764-201ENSMUST00000185925 391 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm44936-201ENSMUST00000207324 735 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm7664-201ENSMUST00000221988 745 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 AC140393.4-201ENSMUST00000226994 765 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 AC163646.3-201ENSMUST00000228879 772 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Cnfn-201ENSMUST00000076276 524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm14239-201ENSMUST00000116491 685 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm13527-201ENSMUST00000117926 691 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm12168-201ENSMUST00000119051 368 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm22669-201ENSMUST00000158723 318 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 AC107851.1-201ENSMUST00000215982 417 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 CT025603.2-201ENSMUST00000224369 484 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 A830005F24Rik-201ENSMUST00000065465 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Tead4-203ENSMUST00000130454 1718 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 AC139845.1-201ENSMUST00000147013 1334 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Naa38-204ENSMUST00000144531 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Plut-201ENSMUST00000172461 855 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm5561-201ENSMUST00000178932 480 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm27383-201ENSMUST00000184418 361 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm5960-201ENSMUST00000188483 406 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm44920-201ENSMUST00000206503 746 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 AC163351.1-201ENSMUST00000225539 737 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Spz1-201ENSMUST00000050658 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Vmn1r44-203ENSMUST00000226120 1772 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms