Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Anks1b-210ENSMUST00000182113 3553 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap2lQ7TS74 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms