Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Trpc5-201ENSMUST00000040184 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Ighv1-22-201ENSMUST00000103507 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Crisp4-203ENSMUST00000115344 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm14276-201ENSMUST00000117941 720 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm22481-201ENSMUST00000122562 192 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm20821-202ENSMUST00000180352 684 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm5652-201ENSMUST00000182336 1008 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm18471-201ENSMUST00000208272 452 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm6129-201ENSMUST00000220725 801 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 CT025579.2-201ENSMUST00000225280 816 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Spaca3-201ENSMUST00000103222 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Wfdc16-201ENSMUST00000109336 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm16058-201ENSMUST00000124392 427 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm28309-201ENSMUST00000136302 623 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm3617-201ENSMUST00000173076 555 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Siglech-208ENSMUST00000173835 833 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Mir5108-201ENSMUST00000175276 85 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm6317-201ENSMUST00000183159 1000 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm43851-201ENSMUST00000200726 327 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm7997-201ENSMUST00000210546 980 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm45780-201ENSMUST00000212089 224 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 AC153948.2-201ENSMUST00000218112 505 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Gm5951-201ENSMUST00000220283 504 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Opn1mw-201ENSMUST00000033771 1227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc18Q640L5 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Tmbim7-201ENSMUST00000014673 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Mapk1ip1-202ENSMUST00000118810 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Gm44167-201ENSMUST00000204957 1878 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Tstd2-202ENSMUST00000107772 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Ccdc18Q640L5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Pdha2-201ENSMUST00000057860 2352 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Ccdc18Q640L5 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Ccdc18Q640L5 Apoc3-201ENSMUST00000034586 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Ccdc18Q640L5 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Gm38348-201ENSMUST00000191718 2273 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Spz1-201ENSMUST00000050658 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Gm8817-201ENSMUST00000126769 693 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Gm10045-201ENSMUST00000178657 483 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Eif3k-202ENSMUST00000207683 647 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Zfp640-201ENSMUST00000071320 894 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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