Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm43737-201ENSMUST00000199915 2740 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Tstd2-202ENSMUST00000107772 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Cers3-201ENSMUST00000066475 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp19Q3UJD6 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms