Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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