Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tmod1P49813 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
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Tmod1P49813 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Tmod1P49813 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Tmod1P49813 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Tmod1P49813 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Tmod1P49813 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Tmod1P49813 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Tmod1P49813 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Tmod1P49813 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Tmod1P49813 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Tmod1P49813 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Tmod1P49813 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tmod1P49813 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms