Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm42783-201ENSMUST00000197075 795 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 1700007F19Rik-201ENSMUST00000188418 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Ccdc116-202ENSMUST00000115709 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 A730032A03Rik-202ENSMUST00000143202 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm37813-201ENSMUST00000195003 3695 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm44187-201ENSMUST00000204735 1929 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm15477-202ENSMUST00000143945 2351 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VdrP48281 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VdrP48281 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VdrP48281 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
VdrP48281 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VdrP48281 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VdrP48281 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VdrP48281 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VdrP48281 Sfxn2-201ENSMUST00000026011 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VdrP48281 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VdrP48281 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VdrP48281 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VdrP48281 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VdrP48281 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VdrP48281 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm14481-201ENSMUST00000117178 629 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms