Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Plbd1-201ENSMUST00000032336 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm9516-201ENSMUST00000119684 424 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm14407-201ENSMUST00000121260 447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprkP35822 2410141K09Rik-204ENSMUST00000173583 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Platr25-206ENSMUST00000222303 1171 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Fabp5-201ENSMUST00000029046 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Olfr1155-201ENSMUST00000099843 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm15535-202ENSMUST00000148478 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm37145-201ENSMUST00000193540 2756 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Rpusd4-201ENSMUST00000034543 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprkP35822 4930455D15Rik-201ENSMUST00000181632 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprkP35822 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Tes-201ENSMUST00000076654 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm11546-201ENSMUST00000120297 354 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm26241-201ENSMUST00000174944 101 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm23976-201ENSMUST00000175001 101 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm22463-201ENSMUST00000175274 101 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm22547-201ENSMUST00000175281 101 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm22913-201ENSMUST00000175297 101 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm23282-201ENSMUST00000175306 101 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm25972-201ENSMUST00000175374 101 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm22414-201ENSMUST00000175466 101 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm26235-201ENSMUST00000175533 101 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm25084-201ENSMUST00000175556 101 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm24973-201ENSMUST00000175588 101 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm23292-201ENSMUST00000175618 101 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Pon1-203ENSMUST00000176945 619 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm23646-201ENSMUST00000178119 101 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm24643-201ENSMUST00000178305 101 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm24302-201ENSMUST00000178350 101 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm26386-201ENSMUST00000178407 101 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm25458-201ENSMUST00000178981 101 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm22825-201ENSMUST00000179444 101 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm42067-202ENSMUST00000210917 410 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Arl15-202ENSMUST00000224068 1002 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Ttll7-203ENSMUST00000106134 2664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gpx6-201ENSMUST00000004453 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Ppp1r9a-206ENSMUST00000175962 3769 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Bcas1os2-201ENSMUST00000131931 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Rnasek-203ENSMUST00000141880 465 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 A730090N16Rik-201ENSMUST00000160137 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm42620-201ENSMUST00000197715 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm44204-201ENSMUST00000204722 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Eif3k-202ENSMUST00000207683 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 AC120406.1-201ENSMUST00000220362 482 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm7664-201ENSMUST00000221988 745 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm21818-202ENSMUST00000225144 894 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm17644-201ENSMUST00000181272 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprkP35822 Gm6286-201ENSMUST00000145247 762 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms