Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm35618-201ENSMUST00000223164 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Ube2q1-202ENSMUST00000196726 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm3618-201ENSMUST00000112726 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm15032-201ENSMUST00000118547 411 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm21965-201ENSMUST00000177770 384 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm11109-201ENSMUST00000180289 384 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm17815-201ENSMUST00000198305 895 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm4275-203ENSMUST00000210214 1298 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprmP28828 AC154528.3-201ENSMUST00000228011 679 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm6960-201ENSMUST00000051629 639 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Rpsa-ps2-201ENSMUST00000059546 880 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprmP28828 4933436P19Rik-201ENSMUST00000217736 1442 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Sult6b2-201ENSMUST00000111768 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gm42527-201ENSMUST00000198173 1480 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Als2cr12-201ENSMUST00000055313 1540 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Etfbkmt-201ENSMUST00000047531 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprmP28828 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Casp14-201ENSMUST00000005488 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Ces1e-203ENSMUST00000176282 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm22659-201ENSMUST00000104195 130 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Rab3b-203ENSMUST00000106651 1078 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Rhox1-201ENSMUST00000115210 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm16304-201ENSMUST00000129972 775 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm15416-201ENSMUST00000131080 442 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm12248-201ENSMUST00000137124 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Ly6g6e-202ENSMUST00000172494 464 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Anks1b-209ENSMUST00000182083 416 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm23927-202ENSMUST00000199928 216 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Pramef12-201ENSMUST00000030326 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Pdha2-201ENSMUST00000057860 2352 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm10251-202ENSMUST00000181786 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm5397-201ENSMUST00000121081 1453 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm43585-201ENSMUST00000199375 1403 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 4933427I22Rik-202ENSMUST00000153921 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Tmsb15a-202ENSMUST00000113154 544 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm11621-201ENSMUST00000118253 589 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm8832-201ENSMUST00000119890 395 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm11203-201ENSMUST00000122169 741 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm22762-201ENSMUST00000157395 137 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm3617-201ENSMUST00000173076 555 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm18894-201ENSMUST00000198794 694 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm32858-201ENSMUST00000205246 585 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm16475-202ENSMUST00000209033 528 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm45521-201ENSMUST00000211339 676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 AC159244.2-201ENSMUST00000222051 220 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 CT030664.1-201ENSMUST00000223639 908 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprmP28828 AC107369.2-201ENSMUST00000226154 916 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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