Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Nbr1-203ENSMUST00000103099 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
P18530 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
P18530 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Arid1a-201ENSMUST00000008024 6486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Daam1-201ENSMUST00000085299 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Atp8b3-201ENSMUST00000020383 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
P18530 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms