Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Zfp568-204ENSMUST00000177931 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Plscr2-205ENSMUST00000180154 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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H2-Eb1P04230 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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