Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 BB014433-203ENSMUST00000179941 1543 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Mbnl1-203ENSMUST00000191747 4046 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm43737-201ENSMUST00000199915 2740 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm37036-201ENSMUST00000192836 2506 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Olfr281-201ENSMUST00000109163 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm11191-201ENSMUST00000117231 610 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm13975-201ENSMUST00000119253 782 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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Col5a3Q9JLI2 Gm13551-201ENSMUST00000121286 430 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm14323-201ENSMUST00000122418 627 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm6665-201ENSMUST00000165131 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 1700034B16Rik-201ENSMUST00000180957 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Pln-205ENSMUST00000219921 531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm18783-201ENSMUST00000220465 1151 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm7664-201ENSMUST00000221988 745 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm33466-201ENSMUST00000199819 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm15423-201ENSMUST00000150600 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Col5a3Q9JLI2 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Phactr1-214ENSMUST00000149235 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Col5a3Q9JLI2 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Col5a3Q9JLI2 4930519F09Rik-201ENSMUST00000159347 618 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Col5a3Q9JLI2 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Col5a3Q9JLI2 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Entpd8-202ENSMUST00000114376 1942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Col5a3Q9JLI2 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Col5a3Q9JLI2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Tcl1-201ENSMUST00000041316 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Rnf183-202ENSMUST00000107454 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm12188-201ENSMUST00000117387 310 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm23899-201ENSMUST00000158112 90 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Col5a3Q9JLI2 Atad3aos-204ENSMUST00000174185 482 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Col5a3Q9JLI2 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 232.6 ms