Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Anks1b-210ENSMUST00000182113 3553 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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Trim39Q9ESN2 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim39Q9ESN2 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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