Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 A530021J07Rik-202ENSMUST00000207727 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Lrba-206ENSMUST00000195524 3322 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gm38014-201ENSMUST00000193349 2612 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Daam1-201ENSMUST00000085299 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Fcamr-201ENSMUST00000027670 1743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Platr9-202ENSMUST00000149572 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nop56Q9D6Z1 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms