Protein–RNA interactions for Protein: Q99PF4

Cdh23, Cadherin-23, mousemouse

Predictions only

Length 3,354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh23Q99PF4 Gm14573-201ENSMUST00000150544 451 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Anks1b-209ENSMUST00000182083 416 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Spin3-ps-201ENSMUST00000192825 770 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Gm44204-201ENSMUST00000204722 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Gm2253-201ENSMUST00000211775 414 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Tatdn3-202ENSMUST00000085633 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Vmn1r42-201ENSMUST00000089419 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Psme1-201ENSMUST00000089619 711 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Adam6a-201ENSMUST00000053086 2558 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 P2rx7-201ENSMUST00000031425 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 n-R5s90-201ENSMUST00000103968 118 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Flt3l-210ENSMUST00000211246 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Gm31698-201ENSMUST00000214227 430 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 9330159N22Rik-201ENSMUST00000221530 1031 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 AC154760.1-201ENSMUST00000227218 673 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Gm5397-201ENSMUST00000121081 1453 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Gm17644-201ENSMUST00000181272 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Gm29601-201ENSMUST00000187961 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Srsf7-201ENSMUST00000063417 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Gm13303-201ENSMUST00000117125 1284 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Gm15499-201ENSMUST00000141390 422 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 D7Ertd128e-201ENSMUST00000189744 928 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Ang2-201ENSMUST00000051274 438 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Gm4798-201ENSMUST00000218024 1699 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Gm17169-201ENSMUST00000171382 351 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Gm34597-201ENSMUST00000211189 633 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 AC093022.2-202ENSMUST00000227500 866 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Vgll3-202ENSMUST00000227997 1383 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Trav15-2-dv6-2-201ENSMUST00000103660 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Gm14138-201ENSMUST00000122061 745 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Gm12257-201ENSMUST00000148244 585 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Gm45510-201ENSMUST00000210059 638 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Stat1-203ENSMUST00000186057 3998 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Wdr95-207ENSMUST00000202902 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Tmprss13-201ENSMUST00000034597 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Apex2-205ENSMUST00000112725 3613 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Rhox1-201ENSMUST00000115210 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Tctex1d2-201ENSMUST00000014220 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Gm8907-201ENSMUST00000182240 1003 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Mir25-201ENSMUST00000083460 84 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Gm23037-201ENSMUST00000083874 324 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Entpd8-202ENSMUST00000114376 1942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdh23Q99PF4 Stx12-201ENSMUST00000030698 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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