Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp37Q8C0R0 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp37Q8C0R0 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp37Q8C0R0 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp37Q8C0R0 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp37Q8C0R0 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp37Q8C0R0 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp37Q8C0R0 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp37Q8C0R0 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp37Q8C0R0 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp37Q8C0R0 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp37Q8C0R0 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp37Q8C0R0 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp37Q8C0R0 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp37Q8C0R0 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp37Q8C0R0 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp37Q8C0R0 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp37Q8C0R0 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp37Q8C0R0 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp37Q8C0R0 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp37Q8C0R0 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp37Q8C0R0 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp37Q8C0R0 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp37Q8C0R0 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp37Q8C0R0 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp37Q8C0R0 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp37Q8C0R0 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp37Q8C0R0 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms