Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gpm6b-205ENSMUST00000112227 3294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Atp8b3-201ENSMUST00000020383 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Atxn1-203ENSMUST00000180110 3901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc87-201ENSMUST00000088653 3163 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Atg16l1Q8C0J2 Tpp2-207ENSMUST00000188313 4631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Atg16l1Q8C0J2 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Atg16l1Q8C0J2 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Atg16l1Q8C0J2 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
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Atg16l1Q8C0J2 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm10093-201ENSMUST00000079363 1977 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Slc36a2-201ENSMUST00000039305 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Rasgrp4-201ENSMUST00000032811 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Rasgrp4-202ENSMUST00000094617 4617 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Zfp532-201ENSMUST00000049016 5503 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg16l1Q8C0J2 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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