Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Zfp398Q8BV16 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Zfp398Q8BV16 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp398Q8BV16 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Zfp398Q8BV16 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Zfp398Q8BV16 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Zfp398Q8BV16 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Zfp398Q8BV16 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Zfp398Q8BV16 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Zfp398Q8BV16 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Zfp398Q8BV16 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Zfp398Q8BV16 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Zfp398Q8BV16 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Zfp398Q8BV16 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp398Q8BV16 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp398Q8BV16 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp398Q8BV16 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp398Q8BV16 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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