Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ChfrQ810L3 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms