Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Gm15032-201ENSMUST00000118547 411 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trak1Q6PD31 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms