Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc2Q62029 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pabpc2Q62029 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms