Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q3U6N9 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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