Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Slc26a1-204ENSMUST00000163328 3015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Tmprss13-201ENSMUST00000034597 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GscQ02591 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Fxr1-208ENSMUST00000200392 3014 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Dcx-202ENSMUST00000087313 3120 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 1700006J14Rik-203ENSMUST00000160091 2629 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Casq2-201ENSMUST00000029454 2556 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 AC132467.2-201ENSMUST00000226306 2253 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Sec31b-202ENSMUST00000111985 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 9130221F21Rik-201ENSMUST00000206867 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GscQ02591 A430046D13Rik-201ENSMUST00000180477 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gm12830-201ENSMUST00000137570 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Tspan2-202ENSMUST00000119902 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GscQ02591 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms