Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Pde1bQ01065 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Pde1bQ01065 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms