Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CdaP56389 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CdaP56389 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CdaP56389 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CdaP56389 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CdaP56389 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CdaP56389 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CdaP56389 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CdaP56389 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CdaP56389 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CdaP56389 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CdaP56389 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CdaP56389 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CdaP56389 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CdaP56389 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CdaP56389 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CdaP56389 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CdaP56389 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CdaP56389 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CdaP56389 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CdaP56389 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CdaP56389 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CdaP56389 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CdaP56389 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CdaP56389 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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CdaP56389 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CdaP56389 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CdaP56389 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CdaP56389 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
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CdaP56389 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CdaP56389 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CdaP56389 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CdaP56389 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CdaP56389 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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CdaP56389 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CdaP56389 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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CdaP56389 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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CdaP56389 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CdaP56389 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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CdaP56389 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CdaP56389 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CdaP56389 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CdaP56389 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CdaP56389 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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CdaP56389 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CdaP56389 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CdaP56389 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CdaP56389 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
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CdaP56389 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CdaP56389 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CdaP56389 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CdaP56389 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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CdaP56389 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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CdaP56389 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CdaP56389 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CdaP56389 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CdaP56389 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CdaP56389 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CdaP56389 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CdaP56389 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CdaP56389 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CdaP56389 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CdaP56389 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CdaP56389 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CdaP56389 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CdaP56389 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CdaP56389 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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CdaP56389 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CdaP56389 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CdaP56389 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CdaP56389 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CdaP56389 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CdaP56389 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CdaP56389 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CdaP56389 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CdaP56389 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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