Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm43450-201ENSMUST00000202611 632 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd12P23812 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113 ms