Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Vash2-202ENSMUST00000166139 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ilf3-203ENSMUST00000213518 3513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm38056-201ENSMUST00000193928 5027 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Bco2-201ENSMUST00000119103 2118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm28945-201ENSMUST00000187780 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm29622-201ENSMUST00000190914 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ccpg1-202ENSMUST00000085350 2969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Acox3-201ENSMUST00000068563 3386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Kcnmb1-201ENSMUST00000020362 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ctnnd1-217ENSMUST00000111691 5380 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Pkd1l3-203ENSMUST00000212537 6576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Acaca-201ENSMUST00000020843 9026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Zfp536-206ENSMUST00000176205 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ftsj3-201ENSMUST00000021048 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Meis1-201ENSMUST00000068264 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Usp28-203ENSMUST00000213874 4109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Mfn2-201ENSMUST00000030884 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ubap2l-208ENSMUST00000196843 3975 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Mrps5-201ENSMUST00000028852 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Dclk1-201ENSMUST00000054237 7847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Dcun1d4-201ENSMUST00000063882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ganc-205ENSMUST00000135074 4780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm6150-202ENSMUST00000219888 2977 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Fam135b-201ENSMUST00000022953 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Krt222-201ENSMUST00000038214 2042 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms