Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Gm12927-201ENSMUST00000150252 373 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 1700052H01Rik-201ENSMUST00000196142 717 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01654 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
P01654 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01654 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01654 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01654 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01654 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01654 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01654 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01654 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01654 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
P01654 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01654 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Gm11771-201ENSMUST00000118124 732 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Gm42731-201ENSMUST00000201839 1641 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01654 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms